增值税进项大于销项时，进项按照常规做法填写申报，多余的部分不用填报，系统会自动留到下个月填报时抵用。因此纳税人在申报时和往常一样，正常填写完当月的全部销售额及销项、进项，进项大于销项影响的只是本月的应纳税额。纳税人若进行进项本月账务全处理的话，要将发票全部认证完，并将其全部抵扣处理。

销项税与进项税的区别

1、进项指的是纳税人在本期买入货物时或者应税劳务缴纳的增值税税额，企业把销项税扣减进项税之后得出的数字才是实际应当缴纳的增值税；

2、销售物品或者有应税项的税金时应当缴纳的税金也就是销项税，进项税和销项税所指的就是增值税的进项和销项产生的税。销项税额多是一般纳税人在售卖物品时，向买受方所收取的物品增值税税额。